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低水碘地區是指水碘含量<10微克/升的地區，我國大部分地區外環境水碘含量較低，全國鄉級水碘含量為3.4微克/升，83.6%的鄉水碘含量在10微克/升以下；即使在水碘含量大于10微克/升的鄉中，也存在17.0％的碘缺乏村。
20世紀80年代以來，人們對碘缺乏危害的認識從甲狀腺腫上升到影響腦和身體發育的高度，發現兒童尿碘在50－100微克/升時，仍會有甲腫發生，甲腫率在5%－20%的地區的兒童仍會有輕度智力落后的發生。因此，對碘營養水平和碘缺乏病病區的判定標準做了重大改變：兒童正常尿碘水平由50微克/升提高到100微克/升；非缺碘地區的正常甲腫率由原來的20%以下，改為5%以下。我國絕大多數的非病區均屬于輕度缺碘地區或病區，也應該供應碘鹽。
鹽中的碘量對于碘攝入量已經充足的人群來講，不會帶來醫學上的麻煩。世界衛生組織（WHO）在1994年的聲明中指出：“全面普及食鹽加碘（USI）是消除碘缺乏病的主要公共衛生手段”，“對處于碘缺乏病危害和缺碘狀態的15億多人口來講，他們從全面普及食鹽加碘中所帶來的益處，與少數人因攝碘過多而造成的危險相比是不可同日而語的”。國內對大連長海縣（碘營養充足，兒童尿碘在160微克/升以上）全面普及食鹽加碘的前、后各3年的調查表明：實施食鹽加碘后，甲狀腺疾病特別是甲狀腺功能亢進（甲亢）并未增多。
如果市場同時供應碘鹽和非碘鹽，根本無法避免非碘鹽對病區的干擾，達不到預防碘缺乏的作用。1995年以后，我國采取了普及食鹽加碘的防治策略。從20世紀60年代對病區實行食鹽加碘，近35年時間并未消除碘缺乏病。1995年我國全面普及食鹽加碘措施，僅用了5年的時間，于2000年在全國水平上實現了消除碘缺乏病的階段目標。實踐雄辯地證明：全面普及食鹽加碘是徹底解決碘缺乏病這一古老疾病的最佳干預措施。
由于水源性高碘地區呈片狀分布，在有些縣內高碘地區和缺碘地區是混雜分布的，這給缺碘地區供應碘鹽、高碘地區供應無碘鹽增加了難度。同時，隨著改水工程建設等客觀環境的變化，高碘地區的分布也在發生變化。如北京、內蒙古實施改水工程建設后，原來的高碘鄉鎮水碘含量已經達不到高碘地區的判定標準，需要在這些地區加強監測，根據監測結果決定是否需要供應碘鹽，以保證人群碘營養處于適宜水平。
中國已在絕大多數的高碘地區停供了碘鹽。對有些媒體報道的“食鹽加碘不安全”，衛生部疾病預防控制局有關負責人表示，1995年以來中國建立和完善了碘缺乏病監測系統，包括每年開展1—2次覆蓋所有縣的碘鹽監測，對碘鹽濃度、用戶水平碘鹽覆蓋率和非碘鹽進行動態監測；每2—3年開展一次以省級為單位的碘營養和病情監測，對碘鹽、尿碘水平、甲狀腺腫大率等進行動態評估；一年一度進行碘缺乏病高危地區調查評估工作。根據監測發現的問題，衛生部適時對防治策略進行了必要調整供應不加碘食鹽。
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